Главным героем игры, как и в предыдущих частях, является охотник за сокровищами Нейтан Дрейк. В приключениях его сопровождают лучший друг и наставник Виктор «Салли» Салливан, журналистка и жена Нейтана Елена Фишер, и его старший брат Сэмюэл «Сэм» Дрейк, которого Нейтан считал погибшим на протяжении 15 лет. Главным антагонистом игры является Рэйф Адлер, который 15 лет назад вместе с братьями Дрейками предпринял неудачную попытку по поиску сокровищ Генри Эвери. Унаследовав компанию своего отца, Рэйф для поисков сокровищ и защиты от конкурентов нанял частную военную организацию «Шорлайн»[прим. 2] во главе которой стоит Надин Росс.